• Biologia grzybów
• Grzyby w biotechnologii i medycynie
• Grzyby i porosty
• Lichenologia i lichenoindykacja
• Różnorodność i ewolucja roślin, glonów i grzybów

• Ekologia zapylania kwiatów
• Ekologia zbiorowisk roślinnych
• Roślina a środowisko
• Fitogeografia
• Inwazyjne gatunki roślin, grzybów i zwierząt
• Karpaty Polskie - szata roślinna i jej ochrona
• Środowiska polarne Ziemi

• Dendrologia
• Diversity and evolution of plants
• Fitogeografia
• Inwazyjne gatunki roślin, grzybów i zwierząt
• Karpaty Polskie - szata roślinna i jej ochrona
• Mechanizmy ewolucji w świecie roślin
• Roślinność Wyżyny Małopolskiej
• Rośliny lecznicze
• Rośliny użytkowe z elementami etnobotaniki
• Rośliny zarodnikowe
• Szata roślinna Ziemi
• Środowiska polarne Ziemi
• Flora i fauna Polski
• Adaptacje organizmów do środowisk ekstremalnych

• Apomiksja u roślin
• Biologia owoców i nasion
• Biologia rozwoju roślin
• Koordynacja wzrostu i rozwoju roślin
• Kultury in vitro i eksperymentalna embriologia roślin
• Chromosomy - metody badań i ich zastosowanie w analizie kariotypu

• Karpaty Polskie - szata roślinna i jej ochrona
• Ocena oddziaływania inwestycji na środowisko
• Roślina i człowiek
• Synantropizacja szaty roślinnej

• Paleobiologia
• Paleobotanika
• Palinologia z elementami palinologii sądowej

• Anatomia ekologiczna roślin naczyniowych – pracownia
• Mikrofotografia i dokumentacja fotograficzna badań
• Praktikum z embriologii roślin
• Waloryzacja przyrodnicza
• Inwazyjne gatunki roślin, grzybów i zwierząt
• Rośliny zarodnikowe
• Warsztaty botaniczne
• Zastosowanie Systemów Informacji Geograficznej (GIS) w naukach przyrodniczych

• Rośliny użytkowe z elementami etnobotaniki
• Historia nauk przyrodniczych
• Roślina i człowiek
• Rośliny lecznicze 

• Metody laboratoryjne w badaniach genetycznych*
• Molekularna filogenetyka roślin*
• Programowanie w języku Python z elementami analizy danych i bioinformatyki

* Kursy dostępne tylko dla studentów ścieżki Biologia molekularna